在深圳，胎儿亲子鉴定主要有两种方式，不同方式对应着不同的最佳时间。

无创胎儿亲子鉴定是目前较为常用且安全的方式。最佳检测时间在怀孕满5周及以上至产前都可以进行。此时，孕妇外周血中胎儿游离DNA的含量达到相对稳定且可检测的水平，通过采集孕妇10ml左右的外周血，提取其中胎儿游离DNA，再与疑似父亲的样本进行比对分析，就能准确判断亲子关系。这种方式无需侵入性操作，对孕妇和胎儿都没有风险，不会引发流产、感染等并发症，而且检测结果准确率高达99.99%以上，深受孕妇及其家属的青睐。

绒毛亲子鉴定一般在怀孕10-13周进行。这个时期胎儿的绒毛膜绒毛组织相对丰富，通过专业的医疗手段，在超声引导下经阴道或腹部穿刺采集绒毛样本。不过，绒毛亲子鉴定属于侵入性操作，可能会对子宫造成一定刺激，存在引发感染、流产等风险，虽然概率较低，但仍需谨慎考虑。

羊水亲子鉴定通常在怀孕16-24周开展。此时羊水量较为充足，胎儿在子宫内的活动空间相对较大，通过穿刺抽取适量羊水样本进行检测。但同样，羊水穿刺也是一种侵入性操作，可能会给孕妇和胎儿带来一定风险。

总体而言，无创胎儿亲子鉴定因安全性高、检测时间范围广，成为大多数人的首选。孕妇可根据自身实际情况，在专业医生的指导下选择合适的鉴定方式和时间。