答案是肯定的。在深圳做亲子鉴定，选择不同的样本类型，最终收费确实会有明显差别。

常规样本包括血液、血痕、口腔拭子（口腔黏膜细胞），这类样本采集方便、DNA提取成功率高、处理流程成熟，因此收费相对统一且实惠。以个人隐私亲子鉴定为例，常规样本一般在两千元到两千六百元左右，具体价格因机构而异。

而特殊样本则包括带毛囊的头发、指甲、牙刷、口香糖、烟蒂、精斑、骨骼等。这类样本的DNA含量往往不如常规样本稳定，提取难度更大，实验室需要额外的预处理步骤，甚至可能需要多次提取才能获得可用的DNA信息。因此，使用特殊样本通常会在常规收费基础上加收几百元不等的费用，每份样本加收金额大约在三百到八百元之间，具体要看样本的处理难度。

另外还有一种情况需要注意：如果送检的特殊样本质量较差，比如指甲太短、头发没有毛囊、口香糖被反复咀嚼等，可能导致提取失败。这时候机构会要求重新补样，虽然部分机构不另收费，但也有机构会收取补样费用，这也会间接增加总体开支。

总结来说，如果想在深圳做亲子鉴定又希望节省费用，优先选择血液、血痕或口腔拭子这类常规样本是最经济的做法。特殊样本虽然在隐私性和便利性上有优势，比如不方便到场时可以自行采集毛发或指甲邮寄，但要做好费用会更高的心理准备。建议在鉴定前先咨询机构，确认所选样本对应的具体报价，避免产生意外支出。