在深圳，若对亲子鉴定结果存在疑问，是可以申请重新鉴定的。亲子鉴定结果关乎重大，涉及家庭关系、法律权益等诸多方面，因此法律赋予了当事人申请重新鉴定的权利。

当出现以下情况时，当事人更应考虑申请重新鉴定。一是鉴定过程存在不规范操作，例如样本采集不符合标准流程，可能因样本受到污染、混淆等影响鉴定准确性；或者鉴定机构未严格按照规定的程序和方法进行检测分析，导致结果出现偏差。二是鉴定机构不具备相应资质，若委托的鉴定机构没有经过相关部门的合法认证与授权，其出具的鉴定结果可信度就会大打折扣。三是当事人有新的证据或线索，能合理怀疑原鉴定结果有误，比如发现了可能影响鉴定结果的新样本等。

申请重新鉴定时，要选择有合法资质、信誉良好的鉴定机构。可以向原鉴定机构提出重新鉴定申请，若原机构拒绝或当事人对其不信任，也可另行委托其他符合条件的机构。重新鉴定需按照新委托机构的要求，重新采集样本、履行相关手续。

重新鉴定可能会耗费一定的时间、精力和费用，但为了确保鉴定结果的准确性和公正性，保障自身合法权益，当对原亲子鉴定结果存疑时，积极申请重新鉴定是明智之举。通过重新鉴定，能更清晰地明确亲子关系，避免因错误鉴定结果引发不必要的家庭纠纷和法律问题。